木托盘制作好后，需要放在合适的仓库采取一些方法进行存储，避免出现发霉、损坏、虫蛀等等状况，不然会无法被正常使用，造成了损失。
 
木托盘入库前应检疫除害
 
　　(1)热处理，确保木质材料的中心温度大约56℃，时间达半小时。
　　(2)熏蒸，可直接利用溴甲烷来做熏蒸，温度小也10℃，时间至少一刻钟。
　　2、要预先检查木托盘内含有的水分是不是在标准范围内，结构和质量是否满足包装要求，是否含细菌、害虫等。不然不可装进库里。
　　3、库房保证干燥、通风，以免受潮腐烂、细菌滋生。
　　4、木托盘在装货后，为避免在运输途中遇下雨天气而受潮，应提前为木托盘做好防雨工作，用塑料薄膜整体包裹。
　　木托盘的保存工作没做好，正式使用时会出现很多问题，货物的质量和也会受到影响。